【JPT/Peptides&elephants】丙型肝炎病毒(HCV)、戊型肝炎病毒(HEV)和Rhinovirus(人鼻病毒)相关多肽库

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Hepatitis C virus(丙型肝炎病毒)


丙型肝炎病毒(HCV)是一种具有脂质外壳的RNA病毒,直径50-60nm,其基因组为10kb单链RNA分子。HCV5′和3′非编码区(NCR)分别有319-341 bp,和27-55 bp,含有几个顺向和反向重复序列,可能与基因复制有关。在5′非编码区下游紧接一可读框(ORF),其中基因组排列顺序为5'-C-E1-E2-p7-NS2-NS3-NS4-NS5-3',能编码一由长度约为由3014个氨基酸残基组成的多聚蛋白质前体,后者可经宿主细胞和病毒自身蛋白酶作用后,裂解成10种病毒蛋白,包括三种结构蛋白,即分子量19kDa的核衣壳蛋白(或称核心蛋白,Core)和两种糖蛋白(分子量为33 kDa的E1蛋白,分子量72 kDa的E2蛋白),p7编码一种膜内在蛋白,其功能可能是一种离子通道。非结构蛋白部分则包括NS2、NS3、NS4A、NS5A和NS5B,它对病毒的生活周期非常重要。NS2和NS3具有蛋白酶活性,参与病毒多聚蛋白前体的切割。此外,NS3蛋白还具有螺旋酶活性,参与解旋HCV分子,以协助RNA复制,NS4的功能尚不清楚。NS5A是一种磷酸蛋白,可以与多种宿主细胞蛋白相互作用,对于病毒的复制起重要作用。

Hepatitis E Virus(戊型肝炎病毒)


戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)是单股正链RNA病毒,呈球形、直径27~34nm无囊膜,核衣壳呈二十面体立体对称。HEV基因组长 7.6kb,3′端有poly A尾,有3个开放阅读读框(ORF):ORF1位于5′端(约 2kb)是非结构蛋白基因,含依赖RNA的RNA多聚酶序列;ORF2位于3′端(约 2kb)是结构蛋白的主要部分,可编码核衣壳蛋白;ORF3与ORF1和ORF2有重叠(全长369bp),也是病毒结构蛋白基因,可编码病毒特异性免疫反应抗原。

Rhinovirus(人鼻病毒)


鼻病毒原来是微小核糖核酸病毒科的一个属,后并入肠道病毒属,由单一的正链基因组RNA组成。

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